舰队停止移动是基础但关键的操作，直接影响资源管理和战术执行。最直接的方式是通过舰队界面操作：打开舰队列表，选择目标舰队后点击停止按钮，舰队将立即终止当前移动任务并保持静止状态。若舰队正在执行采集或战斗任务，停止指令会同步中断任务进程。需停止后的舰队仍可能被敌方攻击，建议在安全区域执行此操作。
另一种停止方法是通过重新设定目的地实现。当舰队向目标A移动时，若玩家为其指定新目标B（尤其是当前位置附近），系统会强制终止原路径并转向新目标，从而达到伪停止效果。此方法适用于需要微调舰队位置但不想完全静止的场景，例如资源点边缘停靠或战术迂回。游戏内部分特殊事件（如遭遇黑洞或超能力场）也会强制舰队停止移动，这类情况需通过修复装备或调整航线解决。
进入战斗状态的舰队无法直接停止，但可通过撤退功能使其脱离战斗并返回基地或前哨站。在舰队详情页的行动选项中关闭自动返回基地功能，可让舰队战斗结束后停留在交战位置，便于后续战术部署。需注意，撤退中的舰队仍可能被追击，建议在确保航线安全或友方掩护下执行。
停靠指令是游戏后期的高阶停止方式。2024年6月更新后，玩家可命令舰队停靠至星球、星门、空间站等特定地图物件，停靠后能使用该物件提供的维修、贸易等服务。此操作需在舰队行动菜单中选择停靠指令并指定目标，适合长途航行后的整备或战略据点驻防。部分中立势力哨所还支持停靠后触发合作任务，进一步扩展战术选择。
舰队持续移动会消耗燃料且增加遇敌风险，合理停止能节省资源并降低损耗。建议在资源点采集完成后立即停止工程船，避免空转浪费；战斗舰队则应在安全区域定期停止维修。通过采矿平台或前哨站连接的矿区可实现自动化停采，减少手动操作频次。
当舰队通过曲率航行抵达目标后，保持计划圈内有友方舰船可维持曲率通道，使后续舰队快速抵达。若需完全停止区域内的曲率移动，必须清除所有友方单位或撤销计划圈。该机制常用于快速部署后的防御固守，或紧急终止大规模舰队调度。
